根據行政院主計總處統計，
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，中央捐助設立的財團法人共計一百六十四家。但立法院預算中心評估報告指出，
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，部分財團法人功能相近、或完成階段性任務，
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，卻未整併或裁撤，
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，不僅浪費公帑，
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，更恐因疊床架屋導致效能降低；有鑑於此，
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，政府應盡速研議檢討及評鑑制度，
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，並規畫退場機制，
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，讓部分財團法人早日「功成身退」。
為了配合社會發展的需要及特定政策目的，政府歷年來成立各種不同類型的財團法人。不過，預算評估報告指出，以文建會的「生活美學基金會」為例，分別成立了台灣、彰化、台南、台東四個生活美學基金會，性質相同且業務無差異，為節省經費，應檢討整併。
另外，內政部為了濟助因公傷亡的義勇人員，設立了「義勇消防人員安全濟助基金會」及「台灣省義勇人員安全濟助基金會」兩個財團法人，但二○○七年間，《警消海空協勤民力安全基金設置管理條例》公布施行，將協勤民力納入適用對象，兩法人已完成階段性任務，應檢討其存廢，避免國家資源重複配置。
報告也提到，一九五八年間，政府為了輔導手工業發展，由經濟部設置「台灣手工業推廣中心」，但如今事隔五十四年，台灣產業環境早已有了很大的改變，無法達成當初的設立目的，因此應檢討裁撤、轉型或整併。此外，還有些公法人營運短絀，每年虧損數億元，其中以國家衛生研究院去年虧損九.二億元為最。
評估報告表示，部分公設財團法人的績效不佳，主管機關對其預算編列也未落實監督，因此政府應建立客觀評鑑制度，檢討其是否達成任務，作為經費分配依據。，