旨在解決釣魚台漁業糾紛的台日漁業協議，
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，除重新劃定台日漁民作業區域及兩國執法權限外，
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，為達到「主權不能讓步，
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，資源可以共享」原則，
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，在協議中加入「免責條款」，
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，確定雙方落實協議的行為，
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，不影響各自在海洋法問題的立場。
外交部長林永樂表示，此條款確認協議各項規定不損及台灣主權。
儘管台日達成擱置共識，仍難避免大陸及香港保釣人士挑起主權爭議。針對第三方進入相關海域，台日雙方是否協同行動驅離？或是否與大陸取得默達？林永樂表示，台日後續將就具體行動繼續討論，並會將此次協議向國安會報告，研擬適當方式知會中國大陸。
設協商及爭端排解機制
台日昨天舉行第十七次漁業會談，終於簽署台日漁業協議，以經緯度為依據劃定兩國漁民在釣魚台海域的作業範圍，保障台灣漁民未來在協議海域作業時不再受到日本公務船的驅逐或騷擾；此外將設置台日漁業委員會，做為後續協商及爭端排解的機制。
亞東關係協會與日本交流協會簽訂台日漁業協議，兼任國民黨主席的馬英九總統在中常會表示「非常欣慰」；對於台灣漁民未來在釣島周邊海域作業範圍將擴大，他說，在主權上沒有任何讓步，但在漁權上有相當程度的增加。
台日歷經十六次漁業會談後，終於出現重大突破。馬英九表示，關於主權問題，我方仍堅持釣魚台是中華民國固有領土，附近海域則是台灣漁民長久以來的傳統漁場，海巡署還是會護漁到底。
漁民不是很滿意但欣慰
對於台日漁業談判有突破，保釣人士黃定為表示肯定，但對結果還不滿意。去年九月底帶領漁民們，創下台灣史上最大民間護漁行動的蘇澳區漁會，對於第十七次台日漁業協定的結果，總幹事林月英說：「雖不是很滿意，但仍感欣慰！」相較於前十六次無較具體的結果，這次能有重大突破，外交部、漁業署等單位的努力，都給予肯定。
中方嚴重關切台日協議
針對台日簽署漁業協議，中國外交部發言人洪磊昨天強調，中方在台灣對外交往等問題上的立場是一貫和明確的。中方對日台有關團體商談簽署漁業協議表示嚴重關切；中方要求日方切實恪守「一個中國」原則和在台灣問題上作出的承諾，審慎處理涉台問題。，