上海自貿區將開放人民幣自由兌換，
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，同時也將允許人民幣匯率自由浮動，
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，這也可意味未來區內與區外的匯率會不一樣，
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，大陸將再度啟動境內匯率雙軌制。儘管有學者認為匯率的雙軌制對均衡匯率價格是一大突破，
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，但也引發部分學者擔心，
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，雙軌制恐引發資本套利的行為，
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，特別是跨境人幣套利流動，
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，也有人擔心自貿區會不會成為人民幣套利賭場。
法新社報導，
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，根據自貿區草案計畫，大陸將在風險可控的前提條件下，允許上海自貿區內人民幣自由兌換，且匯率自由浮動。儘管草案沒有明確說明兌換匯率是否單純由市場決定。但有消息指出，草案將開放人民幣匯率自由浮動，若消息屬實，大陸將可能再度啟動境內匯率雙軌制。
上海社會科學院世界經濟研究所國際金融研究室主任周宇表示，一旦實現人民幣匯率自由浮動，自貿區不僅將形成貿易、投資方面的「境內關外」，金融面將真正形成「境外關外」，形成人民幣離岸市場。
惟對上海自貿區開放人民幣資本帳戶，澳新銀行日前報告，警告可能造成部分投機人士，利用跨境人民幣流動套利，此不僅無助實體經濟，跨境套利，恐讓大陸重蹈當年亞洲金融風暴風險。
為避免資本套利引發金融系統風險，周宇認為，要嚴格隔離區內和區外資金，自貿區內的銀行需要徹底分離離岸帳戶與在岸帳戶，建立完善的防火牆制度。不過，上海自由貿易區研究中心副主任陳波認為，香港和深圳前海已有7千億元離岸人民幣業務額度，管理問題應該不大。
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