從考進台大醫學系，
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，到以醫師國考全國第一名成績回到台大醫院任職，
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，柯文哲就跟多數台大人一樣，
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，他不僅愛台大，
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，更以身為台大的一份子為榮。諷刺的是，
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，「傷害自己最深的人，
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，往往正是你最愛的人。」這無疑是柯文哲當下處境的最佳寫照。
一般人初與柯文哲接觸常覺得他怪怪的，
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，不但講話很跳tone，語不驚人死不休，不懂得看場合說話，常令人三條線。但認識久了就會發現，柯文哲是重情重義的人，只是因亞斯伯格症，讓他抓不準人際關係分際。所以喜歡他的人很多，討厭他的也不少。
但柯文哲對台大的愛卻是毋庸置疑的！這份愛讓他幾乎把所有的時間都奉獻給台大、這份愛讓他在台大面臨愛滋器官風暴3天內就扛下所有責任，理由是「若我不跳出來，是要那幾個才20幾歲的小女生（器官勸募協調師、檢驗師）去死嗎？這樣對台大的傷害會更大。」
然而，柯文哲無怨無悔的犧牲與奉獻，非但未換得台大醫院對他的感謝，這兩年他的處境甚至比置身冷宮還不如，不但被硬生生摘掉器官移植小組召集人頭銜，辦公室更一路從2樓「打入」地下4樓的小空間，令人很難想像這是國內第一把交椅葉克膜權威、台大外科教授受到的待遇。
柯文哲的純真、沒心機，讓他自然而然成為媒體寵兒，尤其當媒體在發言尺度有「小警總」之稱的台大醫院四處碰壁時，「柯Ｐ」常是大家唯一的救星。為此動輒遭院方「關切」的柯文哲也常跟記者打趣說：「別再害我啦，地下4樓下面就是往生室。」
人前一如以往妙語如珠，但其實柯文哲的心裡很苦，尤其當他知道在台大醫院愛滋器官移植事件中，他扮演的不是「烈士」，是被賣了還幫人數錢的「笨蛋」時，更是心結難解，夜夜難眠。
為了尋求心靈的解脫，柯文哲這兩年常在台大醫院金山分院院長黃勝堅陪同下往法鼓山跑，沒事在佛祖法相前左繞繞、右繞繞，心情不知不覺便豁然開朗很多。他口中的「果凍」法鼓山方丈果東法師也常開示他，「要抱願，不要抱怨。」，