七十三年十一月間，
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，政府展開「一清專案」掃黑行動，
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，翌年元月九日，
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，楊登魁被警備總司令部以涉嫌違反懲治叛亂條例的罪名逮捕，
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，隨即解送到警備總部羈押，
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，警總軍事檢察官在同年四月廿七日作出不起訴處分，
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，並在五月十六日確定。
但在確定前，楊登魁另案被提報流氓，已於五月八日移送綠島岩灣矯正感訓，後來許多大哥在獄中成立天道盟組織；一直到七十六年十二月一日，岩灣監獄因管理問題發生暴動，楊自願打斷手骨被送回台就醫，才讓消息傳回台灣，也奠定他在黑道中分量。
七十九年間，政府「二清」掃黑，楊又被送感訓，後因涉賭博案避走海外，他在海外寫了封長信，提及自己從廿七歲後連一次違警紀錄都沒有，卻在「江南案」後被以叛亂罪名起訴；七十九年間，他再被點名進了綠島，兩次都是在不准查證、不准與「祕密證人」對質下吃了牢飯。
楊坦承怕的是自己的名字是黑色的宿命，也怕有生之年再被違憲的命令重入牢獄，但楊登魁後來還是返台投案，賭博案最後判刑六月，易科罰金。
八十九年間，政府修正公布《戒嚴時期人民受損權利回復條例》，楊登魁一清專案期間被逮捕羈押一百廿天，台北地院在九十二年六月判決以每天四千元計算，賠償他四十八萬元。，